Rukun Warga merupakan wadah partisipasi masyarakat Kalurahan sebagai mitra kerja pemerintah Kalurahan dalam rangka mengkoordinasikan kegiatan RT. Berdasarkan SK Lurah Kebonharjo; 

KEPUTUSAN LURAH KEBONHARJO NOMOR 90 TAHUN 2020 TENTANG PENGANGKATAN PENGURUS RUKUN WARGA KALURAHAN KEBONHARJO KAPANEWON SAMIGALUH KABUPATEN KULON PROGO MASA BAKTI 2021 - 2026

Berikut nama Ketua RW di wilayah Kebonharjo

1. Suryo Suryo Budi Raharjo Ketua RW 001, Gowok Kebonharjo
2. Amir Susanto Ketua RW 002, Jarakan Kebonharjo
3. Marto Wiharjo Ketua RW 003, Kaliduren Kebonharjo
4. Lamidi Ketua RW 004, KedunggupitKebonharjo
5. Kirji Suwitodarmo Ketua RW 005, Jeringan Kebonharjo
6. Ngatijan Ketua RW 006, Pringtali Kebonharjo
7. Suyono Ketua RW 007, Pelem Kebonharjo
8. Rubidi Ketua RW 008, Gebang Kebonharjo
9. Supriyanto Ketua RW 009, Dangsambuh Kebonharjo
10. Sardi Ketua RW 010, Kleben Kebonharjo