Koordinasi bersama antara Kepala Desa, Kaur, Kasi, staf dan Dukuh diselenggarakan oleh Pemerintah Desa Kebonharjo secara rutin di setiap bulan pada tanggal 19. Rapat koordinasi bertujuan untuk memonitoring dan mengevaluasi kegiatan penyelengaraan pemerintahan dan pembangunan desa, juga menyampaikan informasi dan kebijakan desa dari pemerintah diatasnya. 

Rapat koordinasi dengan agenda pembahasan dari Kaur Umum Aparatur Desa dan Aset adalah mengenai pemilihan keanggotaan Badan Permusyawaratan Desa,  rencana kegiatan peningkatan kapasitas Kepala Desa, perangkat desa dan BPD, peningkatan kapasitas melalui study/belajar ke desa lain,  dan adanya format baru surat pengantar warga (wira wiri) untuk mendapatkan pelayanan di desa.

Dari Kaur Perencanaan dan Keuangan akan berkegiatan pada evaluasi dan monitoring untuk seluruh kegiatan yang dilaksanakan  di tahun 2019 dan dalam tahap penyusunan perubahan APBDES 2019 yang masih menunggu perubahan PAGU anggaran 2019 dari Kabupaten. Dari Kasi Pembangunan merencanakan kegiatan pembangunan berupa corblock di Dusun Dangsambuh, Jeringan dan Jarakan. Sementara Padat Karya pembangunan jalan akan berada di Kleben dan Jarakan.

Di desa Kebonharjo juga sedang dilakukan pembangunan jamban keluarga merupakan bantuan dari PU Daerah Istimewa Yogyakarta, pembangunan RTLH baik dari Desa PU DIY dan Pemda Kulon Progo. Direncanakan pada 06 Oktober 2019 akan dilaksankan bedah rumah untuk Bapak Suparman di Dusun Kaliduren oleh Baznas Kabupaten Kulon Progo.